Génétique Clinique Chromosomique et Moléculaire (Laboratoire)
Présentation de l'activité
Quelques chiffres clés :
- Plus
de 800 caryotypes annuels,
- Plus de 500 ACPA,
- Plus de 2500 ADNs,
- Plus de 5 millions de B et RIHN.
Nos activités s’exercent à la fois dans le domaine clinique :
consultations de diagnostic, de suivi et de conseil génétique et dans le
domaine biologique : cytogénétique et génétique moléculaire. Seules ces
dernières sont abordées ici.
Pour l’activité clinique, cliquer ici.
Activités biologiques :
Nos activités biologiques sont
soumises à habilitations légales, tant pour le laboratoire que pour les
biologistes signant les analyses des caractéristiques génétiques des personnes
ou des fœtus (en prénatal) :
- Cytogénétique (étude des
chromosomes) : caryotype classique, analyse chromosomique sur puce à ADN
(ACPA ou CGH-array), hybridation in situ (FISH), recherche d’aneuploïdies par
QF-PCR,
- Biologie
moléculaire (étude des gènes) : PCR, séquençage, et NGS (séquençage de
nouvelle génération : à moyen débit),
- Membre
de la plateforme AURAGEN de séquençage à très haut débit (plateforme
régionale mise en place pour la moitié sud de la France dans le cadre du
Plan France Médecine Génomique 2025).
Nos analyses sont
effectuées :
- en anténatal :
prélèvements des villosités choriales (PVC) ou de liquide amniotique
(amniocentèse) qui nous sont adressés par les obstétriciens du groupement
hospitalier territorial et d’autres hopitaux.
- en postnatal (le plus
souvent sur prise de sang) : nous recevons des demandes d’analyses
provenant du CHU, des établissements du GHT, de la région, et pour certaines de
toute la France.
Le laboratoire est ouvert du lundi au vendredi de 8 h 00 à 16 h 00.
Pathologies prises en charge :
Toutes les situations génétiques ou pouvant être génétiques sont
prises en charge avec soit des analyses réalisées localement, soit des analyses
adressées à des laboratoires extérieurs.
Nous avons une activité d’expertise pour certaines pathologies (certaines
déficiences intellectuelles, la Sclérose Tubéreuse de Bourneville, l’étude du
gène SHOX).
Analyses effectuées localement :
- anomalies chromosomiques,
- syndromes avec trouble du
neurodéveloppement : X-fragile, Prader-Willi,
Angelman, Partington, Allan-Herndon-Dudley, Sclérose Tubéreuse de Bourneville.
- panel
de plusieurs dizaines de gènes impliqués dans la Déficience Intellectuelle
et l’Autisme (panel DI44).
- exploration des causes de retard statural
(panel de gènes dont SHOX et les gènes du syndrome de Noonan),
- autres pathologies rares, dont : Amyotrophie Spinale
Infantile, microdélétion du chromosome Y dans l’infertilité, Dysplasie
alvéolo-capillaire.
Très prochainement panel de gènes de :
- Myocardiopathies et troubles du rythme
cardiaque,
- Pathologies vasculaires et syndromes d’Ehlers-Danlos,
- Môles
Hydatiformes,
- Obésité.
A la demande des services
cliniques nous réalisons le stockage d’ADN et la mise en banque de cellules
(cellules fœtales, fibroblastes et lignées lymphoblastoïdes).
Nous faisons partie de réseaux nationaux :
- ACLF (Association des
Cytogénéticiens de langue française),
- ANPGM (Association des Praticiens de Génétique
Moléculaire),
- Achropuce (Laboratoires qui réalisent de la CGH-array),
- des
laboratoires de génétique moléculaire sur la Déficience Intellectuelle.